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On sait peu de choses sur Stacy et son mari Mark, si ce n’est qu’ils vivent dans le New Jersey.
Stacy Warner a été la compagne de House durant cinq ans. Ils se sont rencontrés (10 ans environ avant le début de la série) lors d’une partie de paintball « médecins contre juristes » et ont rapidement emménagé ensemble (une semaine après leur premier rendez-vous). Leur histoire prendra fin peu de temps après les problèmes de santé de House, victime d’un infarctus dans la cuisse droite. Alors que ce dernier est plongé dans un coma artificiel avant de subir une opération extrêmement risquée pour conserver l’usage de sa jambe, Stacy, investie du pouvoir de décision médicale, opte pour un traitement moins dangereux qui sauve son compagnon mais le laisse handicapé à vie (1x21 - Three Stories). Leur relation n’y résistera pas : House, qui la juge responsable de son état, se montre incapable de lui pardonner, conduisant ainsi Stacy à le quitter. 
Cette rupture a marqué un tournant dans la vie de House mais aussi celle de Wilson qui a soutenu et épaulé son ami au détriment de son propre couple. Ne supportant plus de ne plus voir son mari, Bonnie Wilson demande le divorce. Mais le jeune oncologue restera en bons termes avec l'avocate. Après tout il récupère House, son reflet négatif mais indissociable.
Environ cinq ans après ces événements, Stacy refait surface à Princeton afin de demander à House de soigner son mari, Mark Warner, dont la maladie n’est pas diagnostiquée (épisode 1x21 Three Stories). House fait son job et sauve ce patient "spécial". Mark étant guéri mais nécessitant une longue rééducation, Stacy décide de rester à Princeton et devient le responsable juridique de l’hôpital. House tente alors de la reconquérir et y parvient.
Les deux anciens amants renouent. Mais les retrouvailles ne sont que de courte durée, alors que Stacy s’apprête à quitter Mark, House rompt avec elle au motif qu’il ne pourra pas la rendre heureuse. Par peur de souffrir à nouveau? Par lâcheté? Ou plus surprenant, par respect et éthique, House renonce à revivre le passé, déterminé à ne pas s'engager, à rester seul aussi longtemps que possible, peu importe la douleur mentale, ou peut-être à cause de cette douleur...
Ulcérée et bafouée dans sa dignité de femme, Stacy quitte alors Princeton en compagnie de son époux (2x11 - Need to Know).
